Proteinski shakovi nisu osmišljeni isključivo za bodybuildere. Sportaši koji se bave trčanjem i treningom izdržljivosti mogu poboljšati svoje rezultate uz pomoć proteina. Uzimanjem proteina prije treninga izdržljivosti pospješujemo izmjenu tvari u organizmu, što znači da tijelo neće razgraditi proteine iz mišića nakon što potroši ostale izvore energije. Također, nakon treninga uneseni proteine potiču razvoj i rast mišića.
Za trening izdržljivosti najbolji su višekomponentni proteini te Gaineri koji sadrže ugljikohidrate. Ugljikohidrati pružaju tijelu dodatnu energiju potrebnu kod treninga izdržljivosti. Gaineri mogu poslužiti i kao zamjena za kompletan obrok.